A série é focada em Sakai Yuuji, um garoto normal que de repente se vê envolvido em um antigo conflito entre forças de balanço e não-balanço.

 Yuuji viu algo que o mudaria para sempre; uma barreira de fogo surgiu e restringia a área ao seu redor. As

pessoas que estavam dentro desta delimitação ocasionada pela barreira, foram paralisadas no tempo, como se estivessem congeladas e dois monstros chamados 'Rinnes' aparecem e começam a devorar essas pessoas. Logo um desses monstros vê que Yuuji continua se movendo e que possuía algo de especial e então um dos 'Rinnes' decide devorá-lo e colher aquilo que Yuuji carregava dentro de si. Quando ele estava preste a ser destruído, uma garota com olhos e cabelos cor de chamas (conhecida por "A caçadora dos cabelos de fogo e Olhos Ardentes) aparece, e o salva. Yuuji descobre através da garota que ele já estava morto e o que agora é apenas um resíduo do que um dia já foi Sakai Yuuji, e que agora é um 'Mystes'. A garota explica que ela é uma Flame Haze e sua missão é manter o equilíbrio existencial entre o mundo de Guze ( mundo paralelo a terra) e a terra.  E a partir daí Shana, nome que Yuuji deu a Flame Haze, passa a segui-lo, pois agora sendo um Mystes, ele ira atrair o inimigo antes de se extinguir.